Le Conseil Général s'est engagé depuis quelques années dans un ambitieux programme de construction de nouveaux collèges et d'amélioration des établissements existants. L'objectif : permettre aux collèges de jouer leur rôle d'outil d'enseignement moderne et performant, de travail agréable et de lieu de diffusion du savoir et de la culture.
Les 57 collèges publics accueillent 30 276 élèves. Le Conseil Général veille par ailleurs à ce que chaque établissement dispose des équipements sportifs nécessaires. Il contribue parallèlement aux dépenses de fonctionnement de ces établissements.

Le Département assure le recrutement et la gestion des TOS .

95 % des TOS travaillant dans les collèges du Haut-Rhin ont exprimé le souhait d’appartenir à la fonction publique territoriale. La collectivité compte 555 agents (dont 467 titulaires). Le Conseil Général a amélioré la situation des personnels TOS en matière de régime indemnitaire, de médecine du travail, de formation professionnelle.
Au 1er janvier 2009, l'ensemble des personnels TOS aura intégré la collectivité.